| 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 1 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | . | 2 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | . | 3 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | . | 4 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | . | 5 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | . | 6 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | . | 7 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | . | 8 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | . | 9 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 1 | 0 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 1 | 1 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 1 | 2 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 1 | 3 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 1 | 4 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 1 | 5 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 1 | 6 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 1 | 7 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 1 | 8 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 1 | 9 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 2 | 0 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 2 | 1 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 2 | 2 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 2 | 3 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 2 | 4 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 2 | 5 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 2 | 6 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 2 | 7 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 2 | 8 | 0 | . | . | . | . | . | . | . | 2 | 9 | 0 | . | . | . | . | . | . | . |
Methanospirillum |
? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | C | A | A | ? | ? | - | - | - | - | U | A | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | G | G | C | C | A | C | A | G | ? | C | A | G | G | U | ? | ? | G | ? | U | - | G | ? | U | C | ? | A | C | A | C | C | C | G | U | U | C | C | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | - | A | C | ? | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | A | C | A | C | C | U | C | A | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | U | G | ? | ? | G | A | - | U | G | A | C | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | ? | ? | ? | ? | C | - | G | C | G | A | G | U | C | C | U | C | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | A | U | C | A | U | C | ? | ? | ? | ? | C | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | U | ? | ? | A | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | U | - | ? | ? | G | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Haloarcula |
? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | U | - | - | ? | ? | - | - | - | - | A | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | G | G | C | C | A | C | A | G | ? | C | G | G | U | G | ? | ? | G | ? | G | G | U | ? | U | G | ? | C | C | U | C | C | C | G | U | A | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | - | A | C | ? | G | G | A | A | G | A | U | A | A | G | C | C | C | A | C | C | A | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | U | U | ? | ? | C | C | - | G | G | G | G | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | C | - | G | C | G | A | G | C | C | U | C | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | A | C | G | C | G | G | ? | ? | ? | ? | U | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | C | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | C | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | A | C | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Halobacterium |
? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | U | A | - | ? | ? | - | - | - | - | A | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | G | G | C | C | A | U | A | G | ? | C | G | G | U | G | ? | ? | G | ? | G | - | G | ? | U | U | ? | A | C | U | C | C | C | G | U | A | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | - | A | C | ? | G | G | A | A | G | A | U | A | A | G | C | C | C | G | C | C | U | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | U | U | ? | ? | C | C | - | G | G | U | C | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | G | A | G | C | C | U | C | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | A | U | C | C | G | G | ? | ? | ? | ? | U | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | C | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | C | U | - | - | - | - | - | - | ? | ? | A | C | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Haloferax |
? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | U | A | - | ? | ? | - | - | - | - | A | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | G | G | C | C | A | G | A | G | ? | C | G | G | U | G | ? | ? | A | ? | G | - | G | ? | U | U | ? | C | C | A | C | C | C | G | U | A | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | - | A | C | ? | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | U | C | A | C | C | U | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | U | U | ? | ? | C | U | - | G | G | U | C | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | A | - | G | C | G | A | U | C | C | U | C | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | A | U | C | C | A | G | ? | ? | ? | ? | U | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | C | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | C | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | C | C | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Halorubrum |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | U | - | - | ? | ? | - | - | - | - | A | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | G | G | C | C | A | A | A | G | ? | C | G | G | C | A | ? | ? | G | ? | G | - | G | ? | A | A | ? | A | G | A | C | C | C | G | U | A | C | C | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | - | A | C | ? | G | G | A | A | G | U | G | A | A | G | C | C | U | G | C | C | A | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | U | A | ? | ? | C | C | - | A | G | C | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | G | A | G | A | C | C | C | U | C | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | G | C | G | C | U | G | G | ? | ? | ? | ? | U | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | C | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | C | U | - | - | - | - | - | A | ? | ? | C | U | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Natrinema |
? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | U | A | - | ? | ? | - | - | - | - | C | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | G | G | C | C | A | C | A | G | ? | C | G | G | C | G | ? | ? | A | ? | G | - | G | ? | U | A | ? | C | C | U | C | C | C | G | U | A | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | - | A | C | ? | G | G | A | A | G | A | U | A | A | G | C | U | C | G | C | C | U | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | U | U | ? | ? | U | C | - | G | G | U | C | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | G | C | G | A | C | C | C | U | C | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | C | C | C | C | G | A | ? | ? | ? | ? | U | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | C | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | C | ? | ? | A | ? | ? | ? | C | C | A | - | - | - | - | - | - | ? | ? | C | U | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Methanolobus |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | - | - | ? | ? | - | - | - | - | U | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | G | G | C | C | A | U | A | G | ? | C | G | G | C | G | ? | ? | G | ? | G | - | G | ? | C | A | ? | A | U | U | C | C | U | G | U | A | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | - | A | C | ? | A | G | A | A | G | A | U | A | A | G | C | C | C | G | C | C | U | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | U | U | ? | ? | C | U | - | A | U | A | C | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | G | U | A | C | U | ? | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | ? | ? | ? | ? | U | - | G | A | G | A | G | U | C | U | U | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | A | U | A | U | G | G | ? | ? | ? | ? | A | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | C | ? | ? | A | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | - | - | C | - | ? | ? | A | A | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Methanosarcina |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | A | G | ? | ? | U | - | - | - | U | U | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | G | C | G | C | C | A | U | A | G | ? | C | G | G | C | A | ? | ? | G | ? | U | - | G | ? | U | A | ? | A | C | U | C | C | U | G | U | A | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | - | A | C | ? | A | G | U | A | G | A | U | A | A | G | C | C | U | G | C | C | C | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | U | U | ? | ? | C | C | - | U | U | A | C | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | U | - | G | C | G | A | G | C | C | U | U | C | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | C | U | C | U | G | G | ? | ? | ? | ? | A | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | C | ? | ? | A | ? | ? | ? | U | - | - | A | C | - | U | C | - | ? | ? | A | C | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Methanosarcina.v |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | A | U | C | ? | ? | - | - | - | - | U | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | A | G | C | C | A | U | A | G | ? | C | G | G | C | A | ? | ? | G | ? | G | - | U | ? | G | U | ? | A | A | U | C | C | U | G | U | A | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | - | A | C | ? | A | G | U | A | G | A | U | A | A | G | C | C | U | G | C | C | C | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | U | U | ? | ? | C | C | U | U | G | C | C | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | U | - | G | C | G | A | G | C | U | - | U | C | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | C | U | C | U | G | G | ? | ? | ? | ? | A | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | - | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | C | ? | ? | A | ? | ? | ? | U | A | - | - | - | - | U | C | - | ? | ? | A | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Nanoarchaeum |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | U | U | U | ? | ? | C | G | U | G | G | G | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | G | G | G | C | C | A | U | A | G | ? | C | G | G | C | C | ? | ? | C | ? | G | G | G | ? | A | A | ? | C | C | A | C | C | C | G | U | A | C | C | C | A | U | C | U | C | G | A | A | C | - | A | C | ? | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | G | G | G | C | C | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | U | C | ? | ? | C | C | - | G | A | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | - | - | G | C | G | A | A | G | G | G | G | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | G | C | U | C | G | G | ? | ? | ? | ? | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | C | C | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Thermoplasma |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | - | - | ? | ? | - | - | - | - | C | A | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | C | G | G | U | C | A | U | A | G | ? | C | A | G | C | A | ? | ? | G | ? | G | - | G | ? | A | A | ? | A | C | A | C | C | A | G | A | U | C | C | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | - | U | C | ? | G | A | C | G | G | U | U | A | A | G | C | C | U | G | C | U | - | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | U | A | ? | ? | U | U | - | G | C | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | C | - | G | C | G | A | G | G | G | U | A | C | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | G | C | G | C | A | A | ? | ? | ? | ? | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | U | ? | ? | A | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | - | - | C | - | ? | ? | A | C | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Methanococcus |
? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | G | A | C | ? | ? | A | - | - | - | U | A | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | C | G | G | U | C | A | A | A | G | ? | C | G | G | A | G | ? | ? | G | ? | U | - | G | ? | U | A | ? | A | C | A | U | C | C | G | A | U | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | U | C | - | U | C | ? | G | G | A | A | A | U | U | A | A | G | C | C | C | U | C | C | A | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | A | U | ? | ? | U | C | - | U | U | U | A | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | - | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | A | U | C | U | A | G | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | C | A | A | A | G | U | ? | ? | ? | ? | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | C | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | U | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | U | - | ? | ? | C | A | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Methanothermococcus |
? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | G | A | U | ? | ? | A | - | - | - | U | A | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | C | G | G | U | C | A | U | A | G | ? | C | G | G | A | G | ? | ? | G | ? | A | - | G | ? | C | C | ? | A | C | A | U | C | C | G | A | U | C | C | C | G | U | C | C | C | G | A | U | C | - | U | C | ? | G | G | A | A | A | U | U | A | A | G | C | C | C | U | C | C | A | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | A | U | ? | ? | A | C | - | C | C | U | A | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | U | U | U | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | C | A | G | G | G | U | ? | ? | ? | ? | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | U | ? | ? | G | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | - | - | U | - | ? | ? | C | A | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Methanothermobacter |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | U | - | - | ? | ? | - | - | - | - | U | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | G | G | U | C | A | U | G | G | ? | C | G | U | G | G | ? | ? | G | ? | G | - | U | ? | U | U | ? | A | U | A | C | C | U | G | A | U | C | U | C | G | U | U | U | C | G | A | U | C | - | U | C | ? | A | G | U | A | G | U | U | A | A | G | U | C | C | U | G | C | U | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | U | U | ? | ? | G | U | G | G | G | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | U | - | U | U | - | - | U | G | C | U | G | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | G | C | C | C | A | C | ? | ? | ? | ? | U | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | A | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | C | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | A | - | ? | ? | C | A | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Methanothermus |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | U | A | ? | ? | - | - | - | - | C | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | G | A | C | C | A | U | A | G | ? | C | G | G | G | G | ? | ? | G | ? | G | - | G | ? | C | C | ? | A | C | A | C | C | U | G | A | A | C | C | C | G | U | U | C | C | G | A | U | C | - | U | C | ? | A | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | C | C | C | C | U | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | U | U | ? | ? | G | G | - | A | G | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | U | - | U | A | G | - | - | U | - | U | G | C | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | G | C | C | U | C | C | ? | ? | ? | ? | A | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | U | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | C | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | C | - | ? | ? | C | C | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Pyrococcus |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | U | A | ? | ? | - | - | - | - | C | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | G | G | U | C | A | U | A | G | ? | C | G | G | G | G | ? | ? | G | ? | G | - | G | ? | C | C | ? | A | C | A | C | C | C | G | G | U | C | U | C | A | U | U | U | C | G | A | A | C | - | C | C | ? | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | C | C | C | C | A | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | A | U | ? | ? | C | C | - | C | G | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | C | - | G | A | G | A | G | G | G | G | G | C | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | C | C | G | G | G | G | ? | ? | ? | ? | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | C | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | C | G | - | - | - | - | - | G | ? | ? | C | C | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Thermococcus |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | U | A | ? | ? | - | - | - | - | C | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | G | G | U | C | A | U | A | G | ? | C | G | G | C | G | ? | ? | G | ? | G | - | G | ? | U | C | ? | A | C | A | C | C | C | G | G | U | C | U | C | G | U | U | U | C | G | A | C | C | - | C | C | ? | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | C | G | C | C | A | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | A | U | ? | ? | C | C | - | C | G | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | C | - | G | G | G | A | G | G | G | G | G | C | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | C | C | G | G | G | G | ? | ? | ? | ? | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | C | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | C | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | C | - | ? | ? | C | A | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Streptomyces |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | U | U | U | ? | ? | - | - | - | - | C | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | U | G | G | U | C | A | U | A | G | ? | C | G | U | U | A | ? | ? | G | ? | G | - | G | ? | A | A | ? | A | C | G | C | C | C | G | G | U | U | A | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | - | C | C | ? | G | G | A | A | G | C | U | A | A | G | C | C | U | U | A | C | A | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | - | ? | ? | - | - | - | C | G | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | G | G | G | A | C | C | C | U | G | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | G | A | G | U | A | G | G | ? | ? | ? | ? | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | C | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | C | G | - | - | - | - | - | A | ? | ? | A | C | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Agrobacterium |
? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | G | A | C | ? | ? | C | - | - | - | U | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | U | G | G | U | C | A | U | C | G | ? | C | G | G | G | G | ? | ? | C | ? | G | - | G | ? | C | U | ? | G | C | A | C | C | C | G | U | U | C | C | C | U | U | U | C | C | G | A | A | C | - | A | C | ? | G | G | C | C | G | U | G | A | A | A | C | G | C | C | C | C | A | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | - | ? | ? | - | - | - | C | A | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | G | U | A | C | U | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | C | - | A | A | G | A | - | - | - | C | G | C | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | G | A | G | U | A | G | G | ? | ? | ? | ? | - | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | C | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | G | - | ? | ? | U | C | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Escherichia |
? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | G | C | C | ? | ? | - | - | - | - | U | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | G | G | C | C | G | U | A | G | ? | C | G | C | G | G | ? | ? | U | ? | G | - | G | ? | U | C | ? | C | C | A | C | C | U | G | A | C | C | C | C | A | U | G | C | C | G | A | A | C | - | U | C | ? | A | G | A | A | G | U | G | A | A | A | C | G | C | C | G | U | A | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | - | ? | ? | - | - | - | C | G | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | G | U | A | G | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | - | - | G | G | U | C | U | C | C | C | C | A | U | G | C | G | A | G | A | G | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | G | G | G | A | A | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | C | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | G | - | ? | ? | C | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Thermus |
? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | A | U | C | ? | ? | C | C | - | - | C | C | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | U | G | C | C | C | A | U | A | G | ? | C | G | G | C | G | ? | ? | U | ? | G | - | G | ? | A | A | ? | C | C | A | C | C | C | G | U | U | C | C | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | - | A | C | ? | G | G | A | A | G | U | G | A | A | A | C | G | C | G | C | C | A | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | - | ? | ? | - | - | - | C | G | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | - | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | G | C | G | A | C | C | G | C | C | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | G | A | G | U | A | G | G | ? | ? | ? | ? | - | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | G | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | G | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | G | - | ? | ? | G | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Aquifex |
? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | C | C | C | ? | ? | - | - | - | - | U | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | U | G | G | C | C | A | U | A | G | ? | C | G | G | G | G | ? | ? | G | ? | G | - | G | ? | A | A | ? | A | C | A | C | C | C | G | G | U | C | C | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | - | C | C | ? | G | G | C | A | G | U | U | A | A | G | C | C | C | C | C | C | A | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | - | ? | ? | - | - | - | C | G | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | A | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | - | C | A | G | C | G | G | C | A | C | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | A | G | U | A | G | G | ? | ? | ? | ? | - | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | C | A | - | - | - | - | - | G | ? | ? | G | G | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Thermotoga |
? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | U | C | C | ? | ? | C | C | - | - | G | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | U | G | C | C | G | A | U | A | C | ? | U | G | G | G | G | ? | ? | C | ? | G | G | G | ? | A | A | ? | A | C | A | C | C | C | G | G | U | U | C | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | - | C | C | ? | G | G | C | C | G | U | U | A | A | G | C | C | G | C | C | C | U | G | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | C | ? | ? | - | - | - | - | G | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | G | U | A | G | U | ? | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | C | - | - | A | G | C | C | C | C | A | U | G | C | G | A | ? | ? | ? | ? | G | A | G | U | A | G | G | ? | ? | ? | ? | - | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | G | C | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | C | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | G | - | ? | ? | G | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Campylobacter |
? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | U | G | U | ? | ? | - | - | - | - | C | C | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | U | G | A | U | U | A | U | A | C | ? | A | G | A | U | G | ? | ? | U | ? | G | - | G | ? | A | A | ? | A | C | G | C | C | U | U | G | C | U | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | - | C | A | ? | A | G | A | A | G | C | U | A | A | G | C | A | C | A | U | C | G | U | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | G | - | ? | ? | - | - | - | U | G | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | A | U | A | C | U | ? | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | C | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | U | A | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | G | C | A | G | G | G | G | G | A | A | A | G | U | A | G | C | U | C | A | U | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | G | G | - | - | - | - | - | A | ? | ? | C | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Chlamydia |
? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | U | - | - | ? | ? | - | - | - | - | U | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | U | G | A | U | A | A | U | A | G | ? | A | G | A | G | A | ? | ? | G | ? | G | - | G | ? | A | A | ? | A | C | A | C | C | U | G | A | C | A | C | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | - | U | C | ? | A | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | U | C | U | G | A | U | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | - | ? | ? | - | - | - | U | G | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | G | U | A | C | U | ? | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | - | - | A | C | A | A | G | A | G | U | A | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | G | A | G | U | A | G | G | ? | ? | ? | ? | - | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | U | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | C | ? | ? | A | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | - | - | G | - | ? | ? | C | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Bacillus |
? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | U | - | - | ? | ? | - | - | - | - | U | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | U | G | A | U | G | A | U | G | G | ? | C | A | G | A | G | ? | ? | A | ? | G | - | G | ? | U | C | ? | A | C | A | C | C | C | G | U | U | C | C | C | A | U | A | C | C | G | A | A | C | - | A | C | ? | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | U | C | U | C | U | A | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | - | ? | ? | - | - | - | C | G | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | G | U | A | G | U | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | C | - | U | U | G | U | C | C | C | - | - | U | G | U | G | A | ? | ? | ? | ? | G | A | G | U | A | G | G | ? | ? | ? | ? | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | U | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | C | A | - | - | - | - | - | - | ? | ? | A | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Geobacillus |
? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | C | - | - | ? | ? | - | - | - | - | U | A | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | U | G | G | U | G | A | U | A | G | ? | C | G | G | A | G | ? | ? | G | ? | G | - | G | ? | A | A | ? | A | C | A | C | C | C | G | U | U | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | - | A | C | ? | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | C | U | C | C | A | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | - | ? | ? | - | - | - | C | G | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | G | U | A | G | U | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | C | - | C | A | G | C | G | C | C | C | C | U | G | C | A | A | ? | ? | ? | ? | G | A | G | U | A | G | G | ? | ? | ? | ? | - | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | U | A | - | - | - | - | - | - | ? | ? | G | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Flavobacterium |
? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | A | - | - | ? | ? | - | - | - | - | A | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | U | G | G | U | U | A | U | U | G | ? | C | G | G | C | G | ? | ? | G | ? | G | - | G | ? | C | U | ? | C | G | A | C | C | U | C | U | U | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | - | A | G | ? | A | G | U | A | G | U | U | A | A | G | C | C | C | G | C | C | U | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | - | ? | ? | - | - | - | A | G | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | - | A | U | G | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | G | A | G | U | A | U | G | ? | ? | ? | ? | - | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | U | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | C | U | - | - | - | - | - | - | ? | ? | U | U | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Spirochaeta |
? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | C | - | - | ? | ? | - | - | - | - | U | G | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | U | G | A | U | C | A | U | A | G | ? | C | G | A | A | G | ? | ? | A | ? | G | - | G | ? | U | C | ? | C | C | A | C | C | C | G | U | U | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | - | A | C | ? | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | U | C | U | U | C | A | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | - | ? | ? | - | - | - | C | G | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | U | U | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | G | A | G | U | A | G | G | ? | ? | ? | ? | - | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | U | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | C | A | - | - | - | - | - | G | ? | ? | G | C | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Archeoglobus |
? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | U | G | C | ? | ? | - | - | - | - | C | G | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | C | G | G | U | C | A | U | A | G | ? | G | A | C | G | G | ? | ? | G | ? | G | - | G | ? | A | A | ? | A | C | A | C | C | C | G | G | A | C | U | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | - | C | C | ? | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | C | C | G | U | U | C | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | U | C | ? | ? | C | C | - | G | C | A | C | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | C | - | G | A | G | A | G | G | G | C | A | C | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | C | U | G | C | G | G | ? | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | A | C | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | C | G | - | - | - | - | - | G | ? | ? | C | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Pyrobaculum |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | C | C | C | ? | ? | C | - | U | A | A | C | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | C | G | G | C | C | A | U | A | G | ? | G | C | G | C | C | ? | ? | G | ? | G | U | G | ? | A | U | ? | A | C | G | C | C | C | G | G | U | C | U | C | A | U | - | C | A | G | A | A | C | - | C | C | ? | G | G | A | A | G | C | U | A | A | G | G | C | C | G | G | C | G | C | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | G | ? | ? | C | U | - | C | G | G | G | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | C | - | G | C | G | A | G | G | G | C | C | C | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | A | C | C | G | G | C | ? | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | G | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | - | - | G | G | G | - | G | - | ? | ? | C | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Desulfurococcus |
? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | G | C | C | ? | ? | C | G | - | - | A | C | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | C | G | G | C | C | A | U | A | G | ? | U | G | G | C | C | ? | ? | G | ? | G | - | G | ? | C | A | ? | A | C | A | C | C | C | G | G | U | C | U | C | G | U | U | U | C | G | A | A | C | - | C | C | ? | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | G | G | C | C | A | - | C | G | U | C | A | G | A | A | C | G | G | C | C | G | U | G | A | - | - | - | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | - | ? | - | - | - | - | - | ? | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | ? | ? | ? | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | ? | ? | ? | ? | - | - | - | G | G | U | C | C | G | A | G | A | G | G | C | C | U | C | G | C | - | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | - | - | A | G | C | C | G | U | U | C | U | G | A | G | C | U | G | G | G | A | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | - | - | C | G | G | G | C | - | ? | ? | A | C | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Sulfolobus |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | C | C | C | ? | ? | - | - | - | - | A | C | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | C | G | G | U | C | A | C | A | G | ? | U | G | A | G | C | ? | ? | G | ? | G | - | G | ? | C | A | ? | A | C | A | C | C | C | G | G | A | C | U | C | A | U | U | U | C | G | A | A | C | - | C | C | ? | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | G | C | U | C | A | - | C | G | U | U | A | G | U | G | G | G | G | C | C | G | U | G | G | - | - | - | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | - | ? | - | - | - | - | - | ? | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | ? | ? | ? | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | ? | ? | ? | ? | - | - | - | A | U | A | C | C | G | U | G | A | G | G | A | U | C | C | G | C | - | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | - | - | A | G | C | C | C | C | A | C | U | A | A | G | C | U | G | G | G | A | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | - | - | G | G | G | - | U | - | ? | ? | U | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Gelidium |
? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | C | - | - | ? | ? | - | - | - | - | A | U | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | C | G | G | C | C | A | U | A | C | ? | U | A | A | G | U | ? | ? | C | ? | G | A | C | ? | A | U | ? | G | U | A | C | C | C | G | A | U | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | - | U | C | ? | G | G | A | A | G | U | C | A | A | G | U | C | G | C | U | U | C | A | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | C | ? | ? | C | G | - | G | G | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | A | - | G | G | G | A | U | C | A | C | U | C | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | U | C | C | C | C | G | ? | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | C | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | A | A | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | U | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Cryptosporidium |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | C | - | - | ? | ? | - | - | - | - | A | A | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | C | G | G | C | C | A | U | A | C | ? | U | A | C | A | U | ? | ? | C | ? | G | - | A | ? | A | U | ? | A | U | A | C | C | G | G | A | U | C | C | C | A | U | - | C | A | G | A | A | C | - | U | C | ? | C | G | A | A | G | U | C | A | A | G | C | G | G | U | G | U | A | A | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | U | ? | ? | U | C | - | G | G | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | G | G | G | A | C | C | A | C | C | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | G | A | C | C | A | G | ? | ? | ? | ? | A | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | U | ? | ? | C | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | C | - | ? | ? | C | U | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Nosema |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | A | - | - | ? | ? | - | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | C | G | G | U | U | A | U | A | U | ? | U | U | A | C | U | ? | ? | G | ? | A | - | A | ? | A | A | ? | C | C | A | C | C | G | G | A | A | C | C | C | A | U | - | C | A | G | A | A | C | - | U | C | ? | C | G | A | A | G | U | U | A | A | A | C | C | A | G | U | A | U | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | C | ? | ? | U | U | - | A | A | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | G | A | G | A | C | C | A | C | U | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | C | G | U | U | G | G | ? | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | G | U | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Zea |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | - | - | ? | ? | - | - | - | - | A | U | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | G | A | U | C | A | U | A | C | ? | C | A | G | C | A | ? | ? | C | ? | U | - | A | ? | A | A | ? | G | C | A | C | C | G | G | A | U | C | C | C | A | U | - | C | A | G | A | A | C | - | U | C | ? | C | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | G | U | G | C | U | U | G | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | C | ? | ? | G | A | - | G | A | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | G | U | G | A | C | C | U | C | C | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | G | U | C | C | U | C | ? | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | A | U | - | - | - | - | - | - | ? | ? | U | C | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Euglena |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | A | - | - | ? | ? | - | - | - | - | G | U | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | C | G | G | C | C | A | U | A | C | ? | U | A | C | C | G | ? | ? | G | ? | G | - | A | ? | A | U | ? | A | C | A | C | C | U | G | A | A | C | C | C | G | U | - | U | C | G | A | U | U | - | U | C | ? | A | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | G | G | G | U | U | A | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | C | ? | ? | C | C | - | A | G | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | ? | - | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | G | C | G | A | C | C | A | C | U | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | C | A | C | U | G | G | ? | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | A | C | - | - | - | - | - | G | ? | ? | C | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Dictyostelium |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | U | - | - | ? | ? | - | - | - | - | A | U | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | C | G | G | C | C | A | U | A | C | ? | U | A | G | G | U | ? | ? | U | ? | G | - | G | ? | A | A | ? | A | C | A | C | A | U | C | A | U | C | C | C | G | U | - | U | C | G | A | U | C | - | U | G | ? | A | U | A | A | G | U | A | A | A | U | C | G | A | C | C | U | C | A | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | C | ? | ? | C | U | - | U | C | C | A | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | G | - | G | A | G | A | C | A | A | C | A | G | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | C | A | U | A | G | G | ? | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | A | U | - | - | - | - | - | - | ? | ? | A | C | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Physarum |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | - | - | ? | ? | - | - | - | - | A | U | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | G | G | C | C | A | U | A | C | ? | U | A | A | G | G | ? | ? | A | ? | G | - | A | ? | A | A | ? | G | C | A | C | C | U | C | A | U | C | C | C | G | U | - | C | C | G | A | U | C | - | U | G | ? | A | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | U | C | C | U | U | C | A | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | C | ? | ? | G | U | - | G | G | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | G | G | G | A | C | C | A | C | C | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | U | C | C | C | A | C | ? | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | A | U | - | - | - | - | - | U | ? | ? | C | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Amoebidium |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | - | - | ? | ? | - | - | - | - | U | U | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | C | G | G | C | C | A | U | A | C | ? | C | U | A | G | C | ? | ? | A | ? | G | - | A | ? | A | A | ? | G | C | A | C | C | C | C | A | U | C | U | C | G | U | - | C | C | G | A | U | C | - | U | G | ? | G | G | A | A | G | U | U | A | A | A | C | U | G | C | U | A | U | G | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | C | ? | ? | G | U | - | G | G | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | G | G | G | A | C | C | A | C | G | C | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | U | A | C | C | A | C | ? | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | A | A | - | - | - | - | - | - | ? | ? | U | C | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Candida |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | - | - | ? | ? | - | - | - | - | U | U | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | G | G | C | C | A | U | A | U | ? | C | U | A | G | C | ? | ? | A | ? | G | - | A | ? | A | A | ? | G | C | A | C | C | G | U | U | C | C | C | C | G | U | - | U | C | G | A | U | C | A | A | C | ? | C | G | U | A | G | U | U | A | A | G | C | U | G | C | U | A | A | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | A | ? | ? | A | U | - | A | C | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | G | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | G | A | G | A | C | C | A | U | A | C | G | C | G | A | ? | ? | ? | ? | A | A | C | U | A | U | U | ? | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | A | A | - | - | - | - | - | - | ? | ? | U | C | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Saccharomyces |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | - | - | ? | ? | - | - | - | - | U | U | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | C | G | G | C | C | A | U | A | U | ? | C | U | A | C | C | ? | ? | A | ? | G | - | A | ? | A | A | ? | G | C | A | C | C | G | U | U | C | U | C | C | G | U | - | C | C | G | A | U | C | A | A | C | ? | U | G | U | A | G | U | U | A | A | G | C | U | G | G | U | A | A | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | C | ? | ? | U | G | - | A | C | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | G | U | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | G | U | G | A | C | C | A | U | A | C | G | C | G | A | ? | ? | ? | ? | A | A | C | U | C | A | G | ? | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | A | A | - | - | - | - | - | - | ? | ? | U | C | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Caenorhabditis |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | C | - | - | ? | ? | - | - | - | - | U | U | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | C | G | A | C | C | A | U | A | U | ? | C | A | C | G | U | ? | ? | U | ? | G | - | A | ? | A | U | ? | G | C | A | C | G | C | C | A | U | C | C | C | G | U | - | C | C | G | A | U | C | - | U | G | ? | G | C | A | A | G | U | U | A | A | G | C | A | A | C | G | U | U | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | U | ? | ? | C | C | - | A | G | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | G | - | G | A | G | A | C | G | G | C | C | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | U | C | C | U | G | G | ? | ? | ? | ? | - | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | A | A | - | - | - | - | - | - | ? | ? | G | C | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Drosophila |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | C | - | - | ? | ? | - | - | - | - | C | A | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | C | G | A | C | C | A | U | A | C | ? | C | A | C | G | C | ? | ? | U | ? | G | - | A | ? | A | U | ? | A | C | A | U | C | G | G | U | U | C | U | C | G | U | - | C | C | G | A | U | C | - | A | C | ? | C | G | A | A | A | U | U | A | A | G | C | A | G | C | G | U | C | G | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | C | ? | ? | G | C | - | G | G | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | G | G | G | A | C | C | G | C | U | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | C | A | C | C | G | C | ? | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | U | G | - | - | - | - | - | G | ? | ? | C | C | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Xenopus |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | C | - | - | ? | ? | - | - | - | - | C | U | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | C | G | G | C | C | A | U | A | C | ? | C | A | C | C | C | ? | ? | U | ? | G | - | A | ? | A | A | ? | G | U | G | C | C | C | G | A | U | A | U | C | G | U | - | C | U | G | A | U | C | - | U | C | ? | G | G | A | A | G | C | C | A | A | G | C | A | G | G | G | U | C | G | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | C | ? | ? | C | U | - | G | G | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | G | A | G | A | C | C | G | C | C | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | U | A | C | C | A | G | ? | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | C | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | - | ? | ? | - | ? | ? | ? | - | A | G | - | - | - | - | - | G | ? | ? | C | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Cryptobranchus |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | C | - | - | ? | ? | - | - | - | - | C | U | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | C | G | G | C | C | A | U | A | C | ? | C | A | C | C | C | ? | ? | U | ? | G | - | A | ? | A | U | ? | G | C | G | C | C | C | G | A | U | C | U | C | G | U | - | C | U | G | A | A | C | - | U | C | ? | A | G | A | A | G | C | U | A | A | G | C | A | G | G | C | U | U | G | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | C | ? | ? | C | U | - | G | G | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | G | A | G | A | C | U | G | C | C | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | U | A | C | C | A | G | ? | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | A | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | C | - | ? | ? | U | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Homo |
? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | U | - | - | ? | ? | - | - | - | - | C | U | ? | ? | ? | ? | A | ? | ? | C | G | G | C | C | A | U | A | C | ? | C | A | C | C | C | ? | ? | U | ? | G | - | A | ? | A | C | ? | G | C | G | C | C | C | G | A | U | C | U | C | G | U | - | C | U | G | A | U | C | - | U | C | ? | G | G | A | A | G | C | U | A | A | G | C | A | G | G | G | U | C | G | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | - | C | ? | ? | C | U | - | G | G | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | A | ? | G | U | A | C | U | ? | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | ? | ? | G | ? | ? | ? | A | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | G | - | G | A | G | A | C | C | G | C | C | U | G | G | G | A | ? | ? | ? | ? | A | U | A | C | C | G | G | ? | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | C | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | ? | A | ? | ? | G | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | C | - | ? | ? | U | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
|
? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? |
Methanospirillum2 |
- | - | - | - | - | U | - | - | - | C | A | A | - | - | - | ? | ? | ? | U | A | - | - | - | - | G | - | - | C | G | G | C | C | A | C | A | G | - | C | A | G | G | U | - | - | G | - | U | ? | G | - | U | C | - | A | C | A | C | C | C | G | U | U | C | C | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | ? | A | C | - | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | A | C | A | C | C | U | C | A | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | G | - | - | G | A | ? | U | G | A | C | - | - | - | - | - | G | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | G | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | C | ? | G | C | G | A | G | U | C | C | U | C | G | G | G | A | - | - | - | - | A | A | U | C | A | U | C | - | - | - | - | C | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | U | G | - | - | - | - | - | - | C | - | U | - | - | A | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | G | U | U | - | - | - | - | - | - | - | - |
Haloarcula2 |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | U | U | - | - | - | - | ? | ? | ? | A | G | - | - | - | - | G | - | - | C | G | G | C | C | A | C | A | G | - | C | G | G | U | G | - | - | G | - | G | ? | G | - | U | U | G | C | C | U | C | C | C | G | U | A | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | ? | A | C | - | G | G | A | A | G | A | U | A | A | G | C | C | C | A | C | C | A | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | U | - | - | C | C | ? | G | G | G | G | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | A | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | C | ? | G | C | G | A | G | C | C | U | C | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | A | C | G | C | G | G | - | - | - | - | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | C | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | A | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Halobacterium2 |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | U | U | A | - | - | - | ? | ? | ? | A | G | - | - | - | - | G | - | - | C | G | G | C | C | A | U | A | G | - | C | G | G | U | G | - | - | G | - | G | ? | G | - | U | U | - | A | C | U | C | C | C | G | U | A | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | ? | A | C | - | G | G | A | A | G | A | U | A | A | G | C | C | C | G | C | C | U | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | U | - | - | C | C | ? | G | G | U | C | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | A | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | ? | - | C | G | A | G | C | C | U | C | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | A | U | C | C | G | G | - | - | - | - | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | C | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | U | A | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Haloferax2 |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | U | U | A | - | - | - | ? | ? | ? | A | G | - | - | - | - | G | - | - | C | G | G | C | C | A | G | A | G | - | C | G | G | U | G | - | - | A | - | G | ? | G | - | U | U | - | C | C | A | C | C | C | G | U | A | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | ? | A | C | - | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | U | C | A | C | C | U | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | U | - | - | C | U | ? | G | G | U | C | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | A | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | A | ? | G | C | G | A | U | C | C | U | C | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | A | U | C | C | A | G | - | - | - | - | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | C | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | C | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Halorubrum2 |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | G | U | A | - | - | - | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | - | G | - | - | C | G | G | C | C | A | A | A | G | - | C | G | G | C | A | - | - | G | - | G | ? | G | - | A | A | - | A | G | A | C | C | C | G | U | A | C | C | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | ? | A | C | - | G | G | A | A | G | U | G | A | A | G | C | C | U | G | C | C | A | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | A | - | - | C | C | ? | A | G | C | U | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | A | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | G | ? | G | A | G | A | C | C | C | U | C | U | G | G | G | A | - | - | - | - | G | C | G | C | U | G | G | - | - | - | - | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | C | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | A | - | - | - | - | - | - | - | C | U | - | - | C | - |
Natrinema2 |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | U | U | A | - | - | - | ? | ? | ? | C | G | - | - | - | - | G | - | - | C | G | G | C | C | A | C | A | G | - | C | G | G | C | G | - | - | A | - | G | ? | G | - | U | A | - | C | C | U | C | C | C | G | U | A | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | ? | A | C | - | G | G | A | A | G | A | U | A | A | G | C | U | C | G | C | C | U | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | U | - | - | U | C | ? | G | G | U | C | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | A | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | G | ? | G | C | G | A | C | C | C | U | C | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | C | C | C | C | G | A | - | - | - | - | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | C | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | A | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | A | - | - | - | - | - | - | - | C | U | - | - | C | - |
Methanolobus2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | G | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | U | G | - | - | - | - | G | - | - | C | G | G | C | C | A | U | A | G | - | C | G | G | C | G | - | - | G | - | G | ? | G | - | C | A | - | A | U | U | C | C | U | G | U | A | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | ? | A | C | - | A | G | A | A | G | A | U | A | A | G | C | C | C | G | C | C | U | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | U | - | - | C | U | ? | A | U | A | C | - | - | - | - | - | U | - | G | U | A | C | U | - | A | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | A | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | U | ? | G | A | G | A | G | U | C | U | U | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | A | U | A | U | G | G | - | - | - | - | A | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | U | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | A | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | A | A | C | - | - | - | - | - | - | - | - |
Methanosarcina2 |
- | - | - | - | - | G | G | A | - | G | U | U | - | - | - | ? | ? | ? | U | G | - | - | - | - | G | - | - | C | - | G | C | C | A | U | A | G | - | C | G | G | C | A | - | - | G | - | U | ? | G | - | U | A | - | A | C | U | C | C | U | G | U | A | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | ? | A | C | - | A | G | U | A | G | A | U | A | A | G | C | C | U | G | C | C | C | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | U | - | - | C | C | ? | U | U | A | C | - | - | - | - | - | U | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | A | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | U | ? | G | C | G | A | G | C | C | U | U | C | G | G | G | A | - | - | - | - | A | C | U | C | U | G | G | - | - | - | - | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | U | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | A | U | A | C | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | A | C | C | - | - | - | - | - | - | - | - |
Methanosarcina.v2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | A | U | C | - | - | - | ? | ? | ? | U | G | - | - | - | - | G | - | - | C | A | G | C | C | A | U | A | G | - | C | G | G | C | A | - | - | G | G | U | ? | G | - | U | A | - | A | - | U | C | C | U | G | U | A | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | ? | A | C | - | A | G | U | A | G | A | U | A | A | G | C | C | U | G | C | C | C | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | U | - | - | C | C | ? | U | U | G | C | - | - | - | - | C | U | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | A | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | U | ? | G | C | G | A | G | C | - | U | U | C | G | G | G | A | - | - | - | - | A | C | U | C | U | G | G | - | - | - | - | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | - | U | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | A | U | A | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | A | G | U | - | - | - | - | - | - | - | - |
Nanoarchaeum2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | U | U | U | - | - | - | ? | ? | ? | C | G | U | G | G | G | A | - | - | G | G | G | C | C | A | U | A | G | - | C | G | G | C | C | C | - | G | - | G | ? | G | - | A | A | - | C | C | A | C | C | C | G | U | A | C | C | C | A | U | C | U | C | G | A | A | C | ? | A | C | - | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | G | G | G | C | C | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | C | - | - | C | C | ? | G | A | G | U | - | - | - | - | - | G | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | C | - | - | - | - | - | - | C | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | C | ? | G | C | G | A | A | G | G | G | G | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | G | C | U | C | G | G | - | - | - | - | G | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | C | - | - | - | - | - | - | - | - |
Thermoplasma2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | G | C | A | - | - | - | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | A | - | - | C | G | G | U | C | A | U | A | G | - | C | A | G | C | A | - | - | G | - | G | ? | G | - | A | A | - | A | C | A | C | C | A | G | A | U | C | C | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | ? | U | C | - | G | A | C | G | G | U | U | A | A | G | C | C | U | G | - | C | U | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | A | - | - | U | U | ? | G | C | G | U | - | - | - | - | - | U | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | U | - | - | - | - | - | A | - | - | - | U | - | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | C | ? | G | C | G | A | G | G | G | U | A | C | G | G | G | A | - | - | - | - | A | G | C | G | C | A | A | - | - | - | - | U | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | G | C | U | G | - | - | - | - | - | - | U | - | U | - | - | A | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | A | C | U | - | - | - | - | - | - | - | - |
Methanococcus2 |
U | - | - | - | - | G | - | - | - | A | C | A | - | - | - | ? | ? | ? | U | A | - | - | - | - | A | - | - | C | G | G | U | C | A | A | A | G | - | C | G | G | A | G | - | - | G | - | U | ? | G | - | U | A | - | A | C | A | U | C | C | G | A | U | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | U | C | ? | U | C | - | G | G | A | A | A | U | U | A | A | G | C | C | C | U | C | C | A | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | A | U | - | - | U | C | ? | U | U | U | A | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | C | - | - | - | - | - | U | - | - | - | A | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | U | ? | - | - | - | - | - | - | - | A | G | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | C | A | A | A | G | U | - | - | - | - | G | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | C | G | - | - | - | - | - | - | U | - | U | - | - | A | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | C | A | C | - | - | - | - | - | - | - | - |
Methanothermococcus2 |
U | - | - | - | - | G | - | - | - | A | U | A | - | - | - | ? | ? | ? | U | A | - | - | - | - | A | - | - | C | G | G | U | C | A | U | A | G | - | C | G | G | A | G | - | - | G | - | A | ? | G | - | C | C | - | A | C | A | U | C | C | G | A | U | C | C | C | G | U | C | C | C | G | A | U | C | ? | U | C | - | G | G | A | A | A | U | U | A | A | G | C | C | C | U | C | C | A | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | A | U | - | - | A | C | ? | C | C | U | A | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | C | - | - | - | - | - | C | - | - | - | A | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | U | ? | - | - | - | - | - | - | - | G | G | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | C | A | G | G | G | U | - | - | - | - | G | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | U | G | - | - | - | - | - | - | U | - | U | - | - | G | - | - | - | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | C | A | C | - | - | - | - | - | - | - | - |
Methanothermobacter2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | U | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | U | G | - | - | - | - | G | - | - | C | G | G | U | C | A | U | G | G | - | C | G | U | G | G | - | - | G | - | G | ? | U | - | U | U | - | A | U | A | C | C | U | G | A | U | C | U | C | G | U | U | U | C | G | A | U | C | ? | U | C | - | A | G | U | A | G | U | U | A | A | G | U | C | C | U | G | C | U | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | U | - | - | G | U | ? | G | G | G | U | - | - | - | - | - | G | U | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | C | - | - | - | - | - | G | - | - | - | G | U | U | U | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | U | ? | G | C | - | - | - | - | - | U | G | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | G | C | C | C | A | C | - | - | - | - | U | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | A | C | U | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | A | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | - | - | - | C | A | A | - | - | - | - | - | - | - | - |
Methanothermus2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | G | U | A | - | - | - | ? | ? | ? | C | G | - | - | - | - | G | - | - | C | G | A | C | C | A | U | A | G | - | C | G | G | G | G | - | - | G | - | G | ? | G | - | C | C | - | A | C | A | C | C | U | G | A | A | C | C | C | G | U | U | C | C | G | A | U | C | ? | U | C | - | A | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | C | C | C | C | U | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | U | - | - | G | G | ? | A | G | G | U | - | - | - | - | - | G | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | C | - | - | - | - | - | A | - | A | C | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | A | ? | G | U | - | - | - | - | - | U | G | C | G | G | G | A | - | - | - | - | A | G | C | C | U | C | C | - | - | - | - | A | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | U | C | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | G | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | C | C | A | - | - | - | - | - | - | - | - |
Pyrococcus2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | G | U | A | - | - | - | ? | ? | ? | C | G | - | - | - | - | G | - | - | C | G | G | U | C | A | U | A | G | - | C | G | G | G | G | - | - | G | - | G | ? | G | - | C | C | - | A | C | A | C | C | C | G | G | U | C | U | C | A | U | U | U | C | G | A | A | C | ? | C | C | - | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | C | C | C | C | A | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | A | U | - | - | C | C | ? | C | G | G | C | - | - | - | - | - | U | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | C | - | - | - | - | - | C | - | - | - | C | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | C | ? | G | A | G | A | G | G | G | G | G | C | G | G | G | A | - | - | - | - | A | C | C | - | G | G | G | - | - | - | - | G | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | C | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | G | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | C | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Thermococcus2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | G | U | A | - | - | - | ? | ? | ? | C | G | - | - | - | - | G | - | - | C | G | G | U | C | A | U | A | G | - | C | G | G | C | G | - | - | G | - | G | ? | G | - | U | C | - | A | C | A | C | C | C | G | G | U | C | U | C | G | U | U | U | C | G | A | C | C | ? | C | C | - | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | C | G | C | C | A | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | A | U | - | - | C | C | ? | C | G | G | U | - | - | - | - | - | U | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | C | - | - | - | - | - | C | - | - | - | C | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | C | ? | G | G | G | A | G | G | G | G | G | C | G | G | G | A | - | - | - | - | A | C | C | - | G | G | G | - | - | - | - | G | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | C | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | G | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | C | A | - | - | C | - | - | - | - | - | - |
Streptomyces2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | U | U | U | - | - | - | ? | ? | ? | C | G | - | - | - | - | G | - | - | U | G | G | U | C | A | U | A | G | - | C | G | U | U | A | - | - | G | - | G | ? | G | - | A | A | - | A | C | G | C | C | C | G | G | U | U | A | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | ? | C | C | - | G | G | A | A | G | C | U | A | A | G | C | C | U | U | A | C | A | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | C | - | - | - | - | ? | - | - | - | - | - | G | A | U | - | G | - | G | U | A | C | U | - | G | C | A | G | G | G | G | G | G | A | - | - | C | C | - | - | - | C | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | U | ? | G | G | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | A | G | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | G | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | C | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | G | - | - | - | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | - | - | - | C | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Agrobacterium2 |
- | - | - | - | - | C | - | - | G | A | C | C | - | - | - | ? | ? | ? | U | G | - | - | - | - | G | - | - | U | G | G | U | C | A | U | C | G | - | C | G | G | G | G | - | - | C | - | G | ? | G | - | C | U | - | G | C | A | C | C | C | G | U | U | C | C | C | U | U | U | C | C | G | A | A | C | ? | A | C | - | G | G | C | C | G | U | G | A | A | A | C | G | C | C | C | C | A | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | C | - | - | - | - | ? | - | - | - | - | - | A | A | U | - | G | - | G | U | A | C | U | - | U | C | G | U | C | - | - | U | C | A | - | - | A | G | - | - | - | A | - | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | C | ? | G | G | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | A | G | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | U | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | A | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | U | C | - | U | - | - | - | - | - | - | - |
Escherichia2 |
- | - | - | - | - | U | - | - | - | G | C | C | - | - | - | ? | ? | ? | U | G | - | - | - | - | G | - | - | C | G | G | C | C | G | U | A | G | - | C | G | C | G | G | - | - | U | - | G | ? | G | - | U | C | - | C | C | A | C | C | U | G | A | C | C | C | C | A | U | G | C | C | G | A | A | C | ? | U | C | - | A | G | A | A | G | U | G | A | A | A | C | G | C | C | G | U | A | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | C | - | - | - | - | ? | - | - | - | - | - | G | A | U | - | G | - | G | U | A | G | U | - | G | U | G | - | G | G | G | U | C | U | - | - | C | C | - | - | - | C | - | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | U | ? | G | C | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | A | G | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | G | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | A | C | U | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | A | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | C | A | - | U | - | - | - | - | - | - | - |
Thermus2 |
- | - | - | A | A | U | - | - | - | C | C | C | - | - | - | ? | ? | ? | C | C | - | - | - | - | G | - | - | U | G | C | C | C | A | U | A | G | - | C | G | G | C | G | - | - | U | - | G | ? | G | - | A | A | - | C | C | A | C | C | C | G | U | U | C | C | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | ? | A | C | - | G | G | A | A | G | U | G | A | A | A | C | G | C | G | C | C | A | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | C | - | - | - | - | ? | - | - | - | - | - | G | A | U | - | G | - | G | U | A | C | U | - | G | G | G | C | G | G | G | C | G | A | - | - | C | C | - | - | - | G | - | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | U | ? | G | G | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | A | G | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | G | U | G | - | - | - | - | - | - | C | - | G | - | - | G | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | G | A | - | U | - | - | - | - | - | - | - |
Aquifex2 |
- | - | - | - | - | C | - | - | - | C | C | C | - | - | - | ? | ? | ? | U | G | - | - | - | - | G | - | - | U | G | G | C | C | A | U | A | G | - | C | G | G | G | G | - | - | G | - | G | ? | G | - | A | A | - | A | C | A | C | C | C | G | G | U | C | C | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | ? | C | C | - | G | G | C | A | G | U | U | A | A | G | C | C | C | C | C | C | A | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | C | - | - | - | - | ? | - | - | - | - | - | G | A | U | - | G | - | A | U | A | C | U | - | G | U | G | C | C | G | G | C | A | G | - | - | C | G | - | - | - | G | - | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | C | ? | G | G | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | A | G | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | U | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | A | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | G | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Thermotoga2 |
- | A | U | - | - | C | - | - | - | C | C | C | - | - | - | ? | ? | ? | G | G | - | - | - | - | G | - | - | U | G | C | C | G | A | U | A | C | - | U | G | G | G | G | - | C | G | - | G | ? | G | - | A | A | - | A | C | A | C | C | C | G | G | U | U | C | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | ? | C | C | - | G | G | C | C | G | U | U | A | A | G | C | C | G | C | C | C | U | G | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | C | - | - | - | - | ? | - | - | - | - | - | G | A | U | - | G | - | G | U | A | G | U | - | A | U | G | G | G | G | G | C | A | G | - | - | C | C | - | - | - | C | - | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | U | ? | G | C | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | A | G | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | G | C | G | C | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | G | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | G | A | - | U | - | - | - | - | - | - | - |
Campylobacter2 |
- | - | - | - | - | A | - | - | - | U | - | - | G | U | - | ? | ? | ? | C | C | - | - | - | - | G | - | - | U | G | A | U | U | A | U | A | C | - | A | G | A | U | G | - | - | U | - | G | ? | G | - | A | A | - | A | C | G | C | C | U | U | G | C | U | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | ? | C | A | - | A | G | A | A | G | C | U | A | A | G | C | A | C | A | U | C | G | U | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | G | U | - | - | - | - | ? | - | - | - | - | - | G | A | U | - | G | - | A | U | A | C | U | - | A | C | G | C | C | - | - | U | U | A | C | U | G | G | - | - | - | C | - | - | - | - | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | G | ? | G | G | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | A | G | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | C | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | A | U | U | G | - | - | - | - | - | - | C | - | G | - | - | G | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | - | - | - | C | U | - | U | - | - | - | - | - | - | - |
Chlamydia2 |
- | - | - | - | - | C | - | - | - | U | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | U | G | - | - | - | - | G | - | - | U | G | A | U | A | A | U | A | G | - | A | G | A | G | A | - | - | G | - | G | ? | G | - | A | A | - | A | C | A | C | C | U | G | A | C | A | C | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | ? | U | C | - | A | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | U | C | U | G | A | U | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | U | - | - | - | - | ? | - | - | - | - | - | G | A | U | - | G | - | G | U | A | C | U | - | A | U | A | C | A | - | - | C | A | A | - | - | G | A | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | U | ? | G | G | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | A | G | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | U | C | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | A | - | - | - | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | C | A | - | U | - | - | - | - | - | - | - |
Bacillus2 |
- | - | - | - | - | U | - | - | - | U | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | U | G | - | - | - | - | G | - | - | U | G | A | U | G | A | U | G | G | - | C | A | G | A | G | - | - | A | - | G | ? | G | - | U | C | - | A | C | A | C | C | C | G | U | U | C | C | C | A | U | A | C | C | G | A | A | C | ? | A | C | - | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | U | C | U | C | U | A | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | C | - | - | - | - | ? | - | - | - | - | - | G | A | U | - | G | - | G | U | A | G | U | U | G | - | - | - | - | - | - | G | G | A | - | - | C | C | - | - | - | U | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | C | C | C | U | ? | G | U | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | A | G | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | G | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | U | C | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | A | - | - | - | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Geobacillus2 |
- | - | - | - | - | C | - | - | - | C | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | U | A | - | - | - | - | G | - | - | U | G | G | U | G | A | U | A | G | - | C | G | G | A | G | - | - | G | - | G | ? | G | - | A | A | - | A | C | A | C | C | C | G | U | U | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | ? | A | C | - | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | C | U | C | C | A | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | C | - | - | - | - | ? | - | - | - | - | - | G | A | U | - | G | - | G | U | A | G | U | U | G | - | - | - | - | - | - | G | G | G | - | - | C | C | - | - | - | A | - | - | - | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | C | C | C | U | ? | G | C | A | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | A | G | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | U | G | - | - | - | - | - | - | C | - | U | - | - | A | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Flavobacterium2 |
- | - | - | - | - | U | - | - | - | A | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | A | G | - | - | - | - | G | - | - | U | G | G | U | U | A | U | U | G | - | C | G | G | C | G | - | - | G | - | G | ? | G | - | C | U | - | C | G | A | C | C | U | C | U | U | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | ? | A | G | - | A | G | U | A | G | U | U | A | A | G | C | C | C | G | C | C | U | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | A | - | - | - | - | ? | - | - | - | - | - | G | A | U | - | G | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | C | A | G | - | - | U | U | - | - | - | A | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | U | ? | G | G | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | A | G | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | U | C | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | U | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Spirochaeta2 |
- | - | - | - | - | C | - | - | - | C | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | U | G | - | - | - | - | G | - | - | U | G | A | U | C | A | U | A | G | - | C | G | A | A | G | - | - | A | - | G | ? | G | - | U | C | - | C | C | A | C | C | C | G | U | U | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | ? | A | C | - | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | U | C | U | U | C | A | G | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | C | - | - | - | - | ? | - | - | - | - | - | G | A | U | - | G | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | C | U | A | - | - | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | C | ? | G | G | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | A | G | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | U | C | G | - | - | - | - | - | - | C | - | C | - | - | A | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U |
Archeoglobus2 |
- | - | - | - | - | A | - | - | - | U | G | C | - | - | - | ? | ? | ? | C | G | - | - | - | - | A | - | - | C | G | G | U | C | A | U | A | G | - | G | A | C | G | G | - | - | G | - | G | ? | G | - | A | A | - | A | C | A | C | C | C | G | G | A | C | U | C | A | U | U | C | C | G | A | A | C | ? | C | C | - | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | C | C | G | U | U | C | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | C | - | - | C | C | ? | G | C | A | C | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | U | - | - | - | - | - | G | - | - | - | U | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | C | ? | G | A | G | A | G | G | G | C | A | C | G | G | G | A | - | - | - | - | A | C | U | G | C | G | G | - | - | - | - | G | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | A | C | C | G | - | - | - | - | - | - | U | - | C | - | - | G | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | U | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Pyrobaculum2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | C | C | C | - | - | C | ? | ? | ? | U | A | - | - | - | - | A | C | C | C | G | G | C | C | A | U | A | G | G | C | G | C | C | G | - | - | G | - | U | ? | G | - | A | U | - | A | C | G | C | C | C | G | G | U | C | U | C | A | U | C | A | - | G | A | A | C | ? | C | C | - | G | G | A | A | G | C | U | A | A | G | G | C | C | G | G | C | G | C | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | G | - | - | C | U | ? | C | G | G | G | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | G | - | - | - | C | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | C | ? | G | C | G | A | G | G | G | C | C | C | G | G | G | A | - | - | - | - | A | A | C | C | G | G | C | - | - | - | - | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | C | U | G | - | - | - | G | G | A | G | - | G | G | - | G | - | - | - | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | U | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Desulfurococcus2 |
- | - | - | - | - | U | - | - | - | G | C | C | - | - | - | ? | ? | ? | C | G | - | - | - | - | A | C | C | C | G | G | C | C | A | U | A | G | - | U | G | G | C | C | - | - | G | - | G | ? | G | - | C | A | - | A | C | A | C | C | C | G | G | U | C | U | C | G | U | U | U | C | G | A | A | C | ? | C | C | - | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | G | G | C | C | A | - | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | C | A | G | A | A | ? | C | G | G | C | - | - | - | - | - | C | - | G | - | - | - | U | - | G | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | G | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | C | ? | G | A | G | A | G | G | C | C | U | C | G | C | - | - | - | - | - | - | A | G | C | C | G | U | U | - | C | U | - | G | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | C | U | G | - | - | - | G | G | A | U | C | G | G | - | G | - | - | - | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | - | - | - | C | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Sulfolobus2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | C | C | C | - | - | - | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | A | C | C | C | G | G | U | C | A | C | A | G | - | U | G | A | G | C | - | - | G | - | G | ? | G | - | C | A | - | A | C | A | C | C | C | G | G | A | C | U | C | A | U | U | U | C | G | A | A | C | ? | C | C | - | G | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | G | C | U | C | A | - | C | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | U | A | G | U | G | ? | G | G | G | C | - | - | - | - | - | C | - | G | - | - | - | U | - | G | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | A | - | - | - | U | - | - | - | - | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | C | ? | G | U | G | A | G | G | A | U | C | C | G | C | - | - | - | - | - | - | A | G | C | C | C | C | A | - | C | U | - | A | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | C | U | G | - | - | - | G | G | A | U | - | G | G | - | G | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | U | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Gelidium2 |
- | - | - | - | - | A | - | - | - | C | A | U | - | - | - | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | G | C | C | A | U | A | C | - | U | A | A | G | U | - | - | C | - | G | ? | A | C | A | U | - | G | U | A | C | C | C | G | A | U | C | C | C | A | U | C | C | C | G | A | A | C | ? | U | C | - | G | G | A | A | G | U | C | A | A | G | U | C | G | C | U | U | C | A | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | - | - | - | C | G | ? | G | G | U | U | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | G | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | A | ? | G | G | G | A | U | C | A | C | U | C | G | G | G | A | - | - | - | - | A | U | C | C | C | C | G | - | - | - | - | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | C | C | G | - | - | - | - | - | - | A | - | A | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | G | - | - | - | - | - | - | - | - | U | - | - | - | - |
Cryptosporidium2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | C | A | A | - | - | - | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | G | C | C | A | U | A | C | - | U | A | C | A | U | - | - | C | - | G | ? | A | - | A | U | - | A | U | A | C | C | G | G | A | U | C | C | C | A | U | C | A | - | G | A | A | C | ? | U | C | - | C | G | A | A | G | U | C | A | A | G | C | G | G | U | G | U | A | A | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | - | - | - | U | C | ? | G | G | U | U | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | A | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | G | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | G | ? | G | G | G | A | C | C | A | C | C | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | G | A | C | C | A | G | A | - | - | - | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | U | C | G | - | - | - | - | - | - | A | - | U | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | C | - | - | - | - | - | - | U | C | - | - | - |
Nosema2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | - | A | U | - | - | - | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | G | U | U | A | U | A | U | - | U | U | A | C | U | - | - | G | - | A | ? | A | - | A | A | - | C | C | A | C | C | G | G | A | A | C | C | C | A | U | C | A | - | G | A | A | C | ? | U | C | - | C | G | A | A | G | U | U | A | A | A | C | C | A | G | U | A | U | G | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | - | - | - | U | U | ? | A | A | U | U | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | A | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | G | - | - | - | A | - | - | - | - | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | G | ? | G | A | G | A | C | C | A | C | U | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | C | G | U | U | G | G | - | - | - | - | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | - | - | - | G | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Zea2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | G | A | U | - | - | - | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | A | U | C | A | U | A | C | - | C | A | G | C | A | - | - | C | - | U | ? | A | - | A | A | - | G | C | A | C | C | G | G | A | U | C | C | C | A | U | C | A | - | G | A | A | C | ? | U | C | - | C | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | G | U | G | C | U | U | G | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | - | - | - | G | A | ? | G | A | G | U | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | A | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | G | - | - | - | A | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | G | ? | G | U | G | A | C | C | U | C | C | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | G | U | C | C | U | C | - | - | - | - | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | U | U | G | - | - | - | - | - | - | C | - | A | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | U | C | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Euglena2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | A | G | U | - | - | - | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | G | C | C | A | U | A | C | - | U | A | C | C | G | - | - | G | - | G | ? | A | - | A | U | - | A | C | A | C | C | U | G | A | A | C | C | C | G | U | U | C | - | G | A | U | U | ? | U | C | - | A | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | C | G | G | G | U | U | A | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | - | - | - | C | C | ? | A | G | U | U | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | G | ? | G | C | G | A | C | C | A | C | U | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | C | A | C | U | G | G | - | - | - | - | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | C | U | G | - | - | - | - | - | - | U | - | A | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | G | C | U | - | - | - | - | - | - | U | - | - | - | - |
Dictyostelium2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | U | A | U | - | - | - | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | G | C | C | A | U | A | C | - | U | A | G | G | U | - | - | U | - | G | ? | G | - | A | A | - | A | C | A | C | A | U | C | A | U | C | C | C | G | U | U | C | - | G | A | U | C | ? | U | G | - | A | U | A | A | G | U | A | A | A | U | C | G | A | C | C | U | C | A | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | - | - | - | C | U | ? | U | C | C | A | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | C | - | - | - | - | - | - | U | - | - | - | - | - | G | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | - | - | - | - | G | ? | G | A | G | A | C | A | A | C | A | G | G | G | G | A | - | - | - | - | A | C | A | U | A | G | G | - | - | - | - | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | C | U | G | - | - | - | - | - | - | U | - | A | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | A | C | - | - | - | - | - | - | - | U | - | - | - | - |
Physarum2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | G | A | U | - | - | - | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | G | C | C | A | U | A | C | - | U | A | A | G | G | - | - | A | - | G | ? | A | - | A | A | - | G | C | A | C | C | U | C | A | U | C | C | C | G | U | C | C | - | G | A | U | C | ? | U | G | - | A | G | A | A | G | U | U | A | A | G | C | U | C | C | U | U | C | A | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | - | - | - | G | U | ? | G | G | U | U | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | G | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | G | ? | G | G | G | A | C | C | A | C | C | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | U | C | C | C | A | C | - | - | - | - | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | C | U | G | - | - | - | - | - | - | C | - | A | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | U | U | C | U | - | - | - | - | - | - | U | - | - | - | - |
Amoebidium2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | G | U | U | - | - | - | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | G | C | C | A | U | A | C | - | C | U | A | G | C | - | - | A | - | G | ? | A | - | A | A | - | G | C | A | C | C | C | C | A | U | C | U | C | G | U | C | C | - | G | A | U | C | ? | U | G | - | G | G | A | A | G | U | U | A | A | A | C | U | G | C | U | A | U | G | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | - | - | - | G | U | ? | G | G | U | U | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | G | - | - | - | - | - | - | C | - | - | - | - | - | G | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | G | ? | G | G | G | A | C | C | A | C | G | C | G | G | G | A | - | - | - | - | A | U | A | C | C | A | C | - | - | - | - | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | C | U | G | - | - | - | - | - | - | U | - | A | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | U | C | - | - | - | - | - | - | - | U | - | - | - | - |
Candida2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | G | U | U | - | - | - | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | G | C | C | A | U | A | U | - | C | U | A | G | C | - | - | A | - | G | ? | A | - | A | A | - | G | C | A | C | C | G | U | U | C | C | C | C | G | U | U | C | - | G | A | U | C | ? | A | A | C | C | G | U | A | G | U | U | A | A | G | C | U | G | C | U | A | A | G | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | - | - | - | A | A | ? | U | A | C | C | G | - | - | - | - | A | - | G | U | A | G | U | - | G | - | - | - | - | - | - | U | - | - | - | - | - | A | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | G | ? | G | A | G | A | C | C | A | U | A | C | G | C | G | A | - | - | - | - | A | A | C | U | A | U | U | - | - | - | - | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | C | U | G | - | - | - | - | - | - | C | - | A | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | U | C | - | - | - | - | - | - | - | U | - | - | - | - |
Saccharomyces2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | G | U | U | - | - | - | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | G | C | C | A | U | A | U | - | C | U | A | C | C | - | - | A | - | G | ? | A | - | A | A | - | G | C | A | C | C | G | U | U | C | U | C | C | G | U | C | C | - | G | A | U | C | ? | A | A | C | U | G | U | A | G | U | U | A | A | G | C | U | G | G | U | A | A | G | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | - | - | - | C | U | ? | G | A | C | C | G | - | - | - | - | A | - | G | U | A | G | U | - | G | - | - | - | - | - | - | U | - | - | - | - | - | A | - | - | - | G | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | G | ? | G | U | G | A | C | C | A | U | A | C | G | C | G | A | - | - | - | - | A | A | C | U | C | A | G | - | - | - | - | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | C | U | G | - | - | - | - | - | - | C | - | A | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | U | C | - | - | - | - | - | - | - | U | - | - | - | - |
Caenorhabditis2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | C | U | U | - | - | - | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | A | C | C | A | U | A | U | - | C | A | C | G | U | - | - | U | - | G | ? | A | - | A | U | - | G | C | A | C | G | C | C | A | U | C | C | C | G | U | C | C | - | G | A | U | C | ? | U | G | - | G | C | A | A | G | U | U | A | A | G | C | A | A | C | G | U | U | G | A | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | U | - | - | - | C | C | ? | A | G | U | U | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | U | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | G | - | - | - | A | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | C | - | - | - | - | G | ? | G | A | G | A | C | G | G | C | C | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | U | C | C | U | G | G | - | - | - | - | A | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | U | U | G | - | - | - | - | - | - | U | - | A | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | A | G | C | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Drosophila2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | C | C | A | - | - | - | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | A | C | C | A | U | A | C | - | C | A | C | G | C | - | - | U | - | G | ? | A | - | A | U | - | A | C | A | U | C | G | G | U | U | C | U | C | G | U | C | C | - | G | A | U | C | ? | A | C | - | C | G | A | A | A | U | U | A | A | G | C | A | G | C | G | U | C | G | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | - | - | - | G | C | ? | G | G | U | U | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | U | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - | G | - | - | - | A | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | G | ? | G | G | G | A | C | C | G | C | U | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | C | A | C | C | G | C | - | - | - | - | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | U | U | G | - | - | - | - | - | - | U | - | U | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | G | C | C | - | - | - | - | - | - | U | - | - | - | - |
Xenopus2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | C | C | U | - | - | - | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | G | C | C | A | U | A | C | - | C | A | C | C | C | - | - | U | - | G | ? | A | - | A | A | - | G | U | G | C | C | C | G | A | U | A | U | C | G | U | C | U | - | G | A | U | C | ? | U | C | - | G | G | A | A | G | C | C | A | A | G | C | A | G | G | G | U | C | G | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | - | - | - | C | U | ? | G | G | U | U | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | U | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | G | - | - | - | A | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | G | ? | G | A | G | A | C | C | G | C | C | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | U | A | C | C | A | G | - | - | - | - | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | U | C | G | - | - | - | - | - | - | U | - | A | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | G | C | U | - | - | - | - | - | - | U | - | - | - | - |
Cryptobranchus2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | C | C | U | - | - | - | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | G | C | C | A | U | A | C | - | C | A | C | C | C | - | - | U | - | G | ? | A | - | A | U | - | G | C | G | C | C | C | G | A | U | C | U | C | G | U | C | U | - | G | A | A | C | ? | U | C | - | A | G | A | A | G | C | U | A | A | G | C | A | G | G | C | U | U | G | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | - | - | - | C | U | ? | G | G | U | U | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | U | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | G | - | - | - | A | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | G | ? | G | A | G | A | C | U | G | C | C | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | U | A | C | C | A | G | - | - | - | - | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | C | U | G | - | - | - | - | - | - | U | - | A | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | G | C | U | - | - | - | - | - | - | U | - | U | - | - |
Homo2 |
- | - | - | - | - | G | - | - | - | U | C | U | - | - | - | ? | ? | ? | A | - | - | - | - | - | - | - | - | C | G | G | C | C | A | U | A | C | - | C | A | C | C | C | - | - | U | - | G | ? | A | - | A | C | - | G | C | G | C | C | C | G | A | U | C | U | C | G | U | C | U | - | G | A | U | C | ? | U | C | - | G | G | A | A | G | C | U | A | A | G | C | A | G | G | G | U | C | G | G | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | C | - | - | - | C | U | ? | G | G | U | U | - | - | - | - | - | A | - | G | U | A | C | U | - | U | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | G | - | - | - | A | - | - | - | - | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | - | - | - | - | G | ? | G | A | G | A | C | C | G | C | C | U | G | G | G | A | - | - | - | - | A | U | A | C | C | G | G | - | - | - | - | G | U | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | - | G | C | U | G | - | - | - | - | - | - | U | - | A | - | - | - | - | - | - | - | ? | ? | ? | ? | ? | ? | G | G | C | U | - | - | - | - | - | - | U | - | U | - | - |
| |