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Bacillus -U---U---------------UGG--------UGAUGAUGG-CAGAG-AG-GUCACACCCGUUCCCAUACCGAACA-CGGAAGUUAAGCUCUCUAGCG-----CCG----AU----G--GUAGUUGGG----ACCUUG-----U-------C---CCUGUGAGAGUA-------GGACGUCGCCA---A---GC-------
Flavobacterium -U---A---------------AGG--------UGGUUAUUG-CGGCG-GG-GCUCGACCUCUUCCCAUCCCGAACA-GAGUAGUUAAGCCCGCCUGCG-----CAG----AU----G--GUACUGCAG---------U-----U-------A---UGUGGGAGAGUA-------UGUCGUCGCCU---U---UC-------
Agrobacterium -CG--A--CC-----------UGG--------UGGUCAUCG-CGGGG-CG-GCUGCACCCGUUCCCUUUCCGAACA-CGGCCGUGAAACGCCCCAGCG-----CCA----AU----G--GUACUUCGU-----CUCAA-----G-------A---CGCGGGAGAGUA-------GGUCGCUGCCA---G---GUCU-----
Campylobacter -A---U-----------GU--CCG--------UGAUUAUAC-AGAUG-UG-GAAACGCCUUGCUCCAUCCCGAACC-AAGAAGCUAAGCACAUCGUGG-----GUG----AU----G--AUACUACGC-----CUUAC-----U--------GGCAGGGGGAAAGUA-------GCUCAUUGC-G---G---ACUU-----
Escherichia -U---G--CC-----------UGG--------CGGCCGUAG-CGCGG-UG-GUCCCACCUGACCCCAUGCCGAACU-CAGAAGUGAAACGCCGUAGCG-----CCG----AU----G--GUAGUGUGGG----GUCUC-----C-------C---CAUGCGAGAGUA-------GGGAACUGCCA---G---GCAU-----
Thermotoga -A---UCCCC-----------GGG--------UGCCGAUAC-UGGGG-CGGGAAACACCCGGUUCCAUUCCGAACC-CGGCCGUUAAGCCGCCCUGGG-----CCG----AU----G--GUAGUAUGG-GGG--CAGC-----C-------C---CAUGCGAGAGUA-------GGUAGCGCCCG---G---GGAU-----
Thermus -A---AUCCC-----------CCG--------UGCCCAUAG-CGGCG-UG-GAACCACCCGUUCCCAUUCCGAACA-CGGAAGUGAAACGCGCCAGCG-----CCG----AU----G--GUACUGGGC-GGG--CGAC-----C-------G---CCUGGGAGAGUA-------GGUCGGUGCGG---G---GGAU-----
Methanothermobacter -G---U---------------UGG--------CGGUCAUGG-CGUGG-GG-UUUAUACCUGAUCUCGUUUCGAUCU-CAGUAGUUAAGUCCUGCUGCGUU--GUGG----GUGU-----GUACUGCGG---------UUUUUUG-------C---UGUGGGA-----AGCCCA-CUUCACUGCCA---G---AC--AA---
Methanospirillum -U-CAA---------------UAG--------CGGCCACAG-CAGGU-GU-GUCACACCCGUUCCCAUUCCGAACA-CGGAAGUUAAGACACCUCACGUG--GAUG----AC----G--GUACUGAGG---------U-----ACGCGAGUC---CUCGGGA-----AAUCAU-CCUCGCUGCUA---U---UG--UU---
Nanoarchaeum -G---U---------------U--UCGUGGGAGGGCCAUAG-CGGCCCGG-GAACCACCCGUACCCAUCUCGAACA-CGGAAGUUAAGCCGGGCCGCGUC--CCGA----GU----G--GUACUGC-----------C-----CCGCGAAGG---GGUGGGA-----AGCUCG-GGAUGC-------------C---C---
Thermoplasma -G---G---------------CAA--------CGGUCAUAG-CAGCA-GG-GAAACACCAGAUCCCAUUCCGAACU-CGACGGUUAAGCCUG-CUGCGUA--UUGC----GU----U--GUACUGUAU---------G-----CCGCGAGGG---UACGGGA-----AGCGCA-AUAUGCUGUUA---C---CA--CU---
Methanococcus UG---A---------CA----UAA--------CGGUCAAAG-CGGAG-GU-GUAACAUCCGAUCCCAUCCCGAUCU-CGGAAAUUAAGCCCUCCAGCGAU--UCUU----UA----A--GUACUGCUA---------U-----C-------U---AGUGGGA-----ACAAAG-UGACGCCGUUA---G---UC--AC---
Thermococcus -G---G---------UA----CGG--------CGGUCAUAG-CGGCG-GG-GUCACACCCGGUCUCGUUUCGACCC-CGGAAGUUAAGCCCGCCAGCGAU--CCCG----GU----U--GUACUGCCC---------U-----CCGGGAGGG---GGCGGGA-----A-CCGG-GGACGCCGCCG---G---CC--AC---
Pyrobaculum -G---C----CCCUA------ACC--------CGGCCAUAGGCGCCG-GU-GAUACGCCCGGUCUCAUCA-GAACC-CGGAAGCUAAGGCCGGCGCCGCG--CUCG----GG----A--GUACUGGGC---------U-----CCGCGAGGG---CCCGGGA-----AACCG--GCGUGCUG---GGAGGGGGC--UU---
Sulfolobus -G---C-------------CCACC--------CGGUCACAG-UGAGC-GG-GCAACACCCGGACUCAUUUCGAACC-CGGAAGUUAAGCCGC-UCACGU--UA----GUGG----GGCCG---UGGAU---------A-----CCGUGAGGA---UCCGC-A-----GCCCCA-CUAAGCUG---GGAUGGGUU--UU---
Halorubrum -G---U---------------AGG--------CGGCCAAAG-CGGCA-GG-GAAAGACCCGUACCCAUUCCGAACA-CGGAAGUGAAGCCUGCCAGCGUA--CCAG----CU----A--GUACUGGAG---------U-----GGGAGACCC---UCUGGGA-----GCGCUG-GUUCGCCGCCU-------AC--UC---
Cryptosporidium -G---C---------------AAU--------CGGCCAUAC-UACAU-CG-AAUAUACCGGAUCCCAUCA-GAACU-CCGAAGUCAAGCGGUGUAAGGU---UCGG----UU----A--GUACUAGGG---------U-----GGGGGACCA---CCUGGGA-----AGACC-AGAAUGUCGAUC-------GC--C-UC-
Candida -G---G---------------UUG--------CGGCCAUAU-CUAGC-AG-AAAGCACCGUUCCCCGUUC-GAUCAACCGUAGUUAAGCUGCUAAGAGC-A--AUAC----C--G-A--GUAGUGUAG---------U-----GGGAGACCA---UACGCGA-----AACUA--UUGUGCUGCAA-------UC--U----
Drosophila -G---C---------------CAA--------CGACCAUAC-CACGC-UG-AAUACAUCGGUUCUCGUCC-GAUCA-CCGAAAUUAAGCAGCGUCGGGC---GCGG----UU----A--GUACUUAGA---------U-----GGGGGACCG---CUUGGGA-----ACACC--GCGUGUUGUUG-------GC--C-U--
Euglena -G---A---------------GUA--------CGGCCAUAC-UACCG-GG-AAUACACCUGAACCCGUUC-GAUUU-CAGAAGUUAAGCCGGGUUAGGC---CCAG----UU----A--GUACUGAG----------U-----GGGCGACCA---CUUGGGA-----ACACU--GGGUGCUGUAC-------GC--U-U--
Homo -G---U---------------CUA--------CGGCCAUAC-CACCC-UG-AACGCGCCCGAUCUCGUCU-GAUCU-CGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGC---CUGG----UU----A--GUACUUGGA---------U-----GGGAGACCG---CCUGGGA-----AUACC--GGGUGCUGUAG-------GC--U-U-U
Nosema -G-------------------AUA--------CGGUUAUAU-UUACU-GA-AAACCACCGGAACCCAUCA-GAACU-CCGAAGUUAAACCAGUAUGAGC---UUAA----UU----A--GUACUAAGA---------A-----GGGAGACCA---CUUGGGA-----ACGUU--GGGUGG--UA-----------------
Zea -G---G---------------AUG--------CGAUCAUAC-CAGCA-CU-AAAGCACCGGAUCCCAUCA-GAACU-CCGAAGUUAAGCGUGCUUGGGC---GAGA----GU----A--GUACUAGGA---------U-----GGGUGACCU---CCUGGGA-----AGUCC--UCGUGUUGCAU-------UC--C----
Caenorhabditis -G---C---------------UUA--------CGACCAUAU-CACGU-UG-AAUGCACGCCAUCCCGUCC-GAUCU-GGCAAGUUAAGCAACGUUGAGU---CCAG----UU----A--GUACUUGGA---------U-----CGGAGACGG---CCUGGGA-----AUCCU--GGAUGUUGUAA-------GC----U--
Dictyostelium -G---U---------------AUA--------CGGCCAUAC-UAGGU-UG-GAAACACAUCAUCCCGUUC-GAUCU-GAUAAGUAAAUCGACCUCAGGC---CUUC----CA----A--GUACUCUGG---------U-----UGGAGACAA---CAGGGGA-----ACAUA--GGGUGCUGUAU-------AC----U--